Vinculada ao Conselho de Administração, a AUDIN tem por finalidade fortalecer a gestão e racionalizar as ações de controle, bem como examinar, assessorar, orientar, acompanhar e avaliar os atos de gestão. É composta por servidores da Universidade e possui independência relativa, para a realização de suas atividades com objetividade e transparência.